Sammandrag:
Avsikten är att idka forskning och öka det vetenskapliga och praktiska samarbetet när det gäller forskning i virussjukdomar i synnerhet hos odlad fisk i Finland och utomlands. Trots att tyngdpunkten ligger på IPN-, VHS- och perch rhabdovirus, omfattar projektet även andra virussjukdomar bland fiskar.
Målsättningar:
Projektet syftar huvudsakligen till att främja fiskens hälsa och välbefinnande, öka kunskapen om såväl förekomsten av fiskvirus som faktorer bakom förekomsten och smittvägar. Målet är att identifiera sådana nya fiskvirus som inverkar på fiskens och i synnerhet den odlade fiskens hälsa och välbefinnande.
År 2012 påträffades IPN-smittan (infectious pancreatic necrosis, infektiös pankreasnekros) första gången vid flera fiskodlingsanläggningar i insjöområdet. Anläggningarna fanns i Kymmene älv, Vuoksen och Kemi älv. IPN-virus påträffas årligen på Finlands havsområden, medan förekomsten av IPN var väldigt sällsynt på insjöområdet ända fram till år 2012. Utifrån detta kan IPN-smittan anses vara en fisksjukdomar som hotar Finland och kan orsaka betydande förluster för fisknäringen. Våra preliminära undersökningar visar att de IPNV-stammar som har isolerats från insjöar hör till genotyp 2, medan virusstammar av genotyp 2, 5 och 6 har påträffats på havsområden. Finlands insjöar är helt fria från IPNV-smitta när det gäller genotyp 5. Det är i lag stadgat att IPNV av genotyp 5 är en sjukdom som ska motverkas, det vill säga de åtgärder som vidtas för att förinta sjukdomen sker under ledning av myndigheterna.
Arbetet syftar till att utreda virusgenomet i ett vidare perspektiv genom att sekvensera hur IPN-virus sprids på fiskodlingsanläggningar i inlandet i Finland och om det finns en gemensam källa bakom smittutbrotten runtom i landet samt likväl att reda ut IPN-virusstammarnas släktskapsförhållanden och epidemiologin för smittutbrotten genom att jämföra olika virus hela gensekvenser sinsemellan samt mot andra kända IPNV-stammar. Avsikten är att med hjälp av infektionsprover utreda de finländska IPN-virusstammarnas förmåga att framkalla sjukdom hos regnbågsforell.
Från och med år 2002 har förhöjd dödlighet bland harryngel påträffats på två fiskanläggningar i Insjöfinland. De här anläggningarna odlar ofta artens yngel genom att använda ytvatten. Viruset isolerades från 14 prover. Utifrån en sekvensering av hela G-genen och delvis av RNA-polymeras(L)genen och ett indirekt fluorescerande antikroppstest (IFAT) klassificerades viruset som ett perhabdovirus, det vill säga rhabdovirus som förekommer hos abborre (PRV). G- och L-gensekvenserna visade att alla isoleringar till närapå 100 procent var identiska sinsemellan på de båda anläggningarna. Isoleringarna av rhabdoviruset hos abborre låg mycket nära stammarna som isolerats från abborre, Perca fluviatilis, och havslax, Salmo trutta trutta, fångad i Östersjön. Dessa stammar är närbesläktade med den stam, som isolerats från abborre, harr och gös, Sander lucioperca, i Frankrike samt från gädda, Esox lucius, i Danmark. Sea trout rhabdovirus, ett perhabdovirus som förekommer hos insjööring, Salmo trutta m. lacustris, isolerades i slutet av 1980-talet på en anläggning i norra Finland. Avsikten är att med hjälp av infektionsprover utreda de finländska perahbdovirusstammarnas förmåga att framkalla sjukdom.
Viral hemorrhagisk septikemi (VHS) hos regnbågsforell är en virussjukdom som lätt sprider sig och orsakar fiskdödlighet i stor skala och följaktligen ekonomiska förluster för fiskodlingsanläggningarna. I Finland isolerades VHS-virus första gången år 2000 från sjuka regnbågsforeller, Oncorhynchus mykiss (Walbaum), vid en matfiskanläggning på Åland och vid fyra matfiskanläggningar i Pyttis. Det har forskats i VHS-virusets egenskaper och epidemiologi i projektet "Kalojen tarttuva verenvuotoseptikemia (VHS) Suomessa: viruskantojen tutkimus ja taudin epidemiologia kalanviljelylaitoksilla ja merialueen luonnonkaloissa VHSV – Smittsam viral hemorrhagisk septikemi hos fiskar (VHS) i Finland: Undersökning av virusstammar och sjukdomens epidemiologi vid fiskodlingsanläggningar och hos naturfiskar i havsområdet". Projektet avslutades år 2013. Forskning sker fortfarande när det gäller epidemiologin för de VHSV-stammar som isolerats från Finland.
Ämnessord:
virus, fisk, fiskodling, viruskaraktärisering, epidemiologi
Ansvarig projektledare:
Gadd, Tuija, professor, Livsmedelsverket, forskningsenheten för djursjukdomsvirologi
Livsmedelsverkets projektansvariga:
Gadd, Tuija, enhetschef, enheten för virologi;
Koski, Perttu, specialforskare, VMD, sektionen för vilt- och vattendjurspatologi
Samarbetspartner:
HU, Veterinärmedicinska fakulteten (prof. Liisa Sihvonen);
HU, Institutet för molekylär medicin i Finland, FIMM, (doc. Pirkko Mattila);
Danish Veterinary Laboratory;
Danmarks Tekniske Universitet;
VESO Vikan, Norja;
Prof Öysten Evensen, Norwegian University of Life Sciences, Oslo;
Naturresursinstitutet (Luke)
Projektskede:
Pågående
Startår:
1. delen 2014; 2. delen 2017
Avslutningsår:
1. delen 2016; 2. delen 2021
Publikationer:
Anna Maria Eriksson-Kallio, Riikka Holopainen, Satu Viljamaa-Dirks, Pia Vennerström, Hanna Kuukka-Anttila, Perttu Koski, Tuija Gadd: Infectious pancreatic necrosis virus (IPNV) strain with genetic properties associated with low pathogenicity at Finnish fish farms (DAO Vol. 118: 21–30, 2016 ).
Holopainen R, Eriksson-Kallio AM, Gadd T: Molecular characterisation of Aquabirnaviruses isolated from farmed fish in Finland (manuscript).
Holopainen, R: Tarttuvaa haimakuoliotautia (IPN) aiheuttavien viruskantojen geneettinen monimuotoisuus suomalaisilla kalanviljelylaitoksilla (Eviran tiedepäivä 13.10. 2016, suullinen esitys).
Holopainen R, Eriksson-Kallio AM, Gadd T: Infectious pancreatic necrosis virus – a rising threat to fish farming in Finland? Suullinen esitys, Virology days 2015 26.-27.3.2015 Rauhalahti, Kuopio.
Holopainen R, Eriksson-Kallio AM, Gadd T: GENETIC ANALYSIS OF INFECTIOUS PANCREATIC NECROSIS VIRUSES ISOLATED IN FINLAND DURING 2000-2014. Suullinen esitys, 19th Annual Workshop of the National Reference Laboratories for Fish Diseases,27-28th May 2015.
R. Holopainen, AM Eriksson-Kallio, T. Gadd: Molecular Characterisation of Infectious Pancreatic Necrosis Viruses Isolated in Finland During 2000-2014 . Posteri, 10th International congress ESVV 2015 for veterinary virology and 9th annual meeting of Epizone 31.8-3.9.15 Montpellier, Ranska.
Gadd, T.
Fish rhabdoviruses: viral haemorrhagic septicaemia virus (VHSV) and perch rhabdovirus (PRV):
study of viral strains and the disease epidemiology in Finland.
University of Helsinki, Faculty of Veterinary Medicine, Department of Veterinary Biosciences.
Academic dissertation.
Holopainen, R., Gadd, T.
Molecular characterisation of Finnish isolates of infectious pancreatic necrosis virus.
16th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish, 2.6.9, 2013 Tampere, Finland.
Abstract, poster.
Gadd, T., Viljamaa-Dirks, S., Holopainen, R., Koski, P., Jakava-Viljanen, M.
Characterization of perch rhabdovirus (PRV) in farmed grayling Thymallus thymallus.
Diseases of Aquatic Organisms Diseases of Aquatic Organisms 2013: Vol. 106, pp. 117–127.
I finansieringen av projektet deltar:
Livsmedelsverket;
Finlands veterinärmedicinska stiftelse;
Euroopan Meri- ja Kalatalousrahasto (EMKR)
Livsmedelsverkets projektnummer:
8258 Finlands IPNV-stammar