E. coli är en bakterie som är allmän i tjocktarmen och ändtarmen hos varmblodiga djur. Ett typiskt antal är 10–100 miljoner celler per gram tarminnehåll. Isolering och preliminär identifiering av E. coli-bakterier är enkelt och bakterien lämpar sig av bland annat dessa orsaker väl som indikatorbakterie för antibiotikaresistens. Värmetåliga koliformade bakterier används för att uttrycka fekal kontaminering av exempelvis hushållsvatten. E. coli används som gramnegativ indikatorbakterie.
Resistens hos indikatorbakterier E. coli från djur
Från och med 2002 har förekomsten av resistens hos E. coli-bakterier som har isolerats från svin, nöt och broilrar regelbundet följts upp. Proverna tas från friska djur i samband med slaktningen. Indikatorbakterier samlas in vartannat år från olika djurarter.
Broilrar
Relativt lite resistens konstateras hos E. coli-bakterier som har isolerats från broilrar. Under det senaste årtiondet har resistens mot vissa antibiotika konstaterats som mest hos cirka 10 procent, förutom 2018 då ampicillinresistens förekom hos cirka 13 procent. Förutom ampicillinresistens har mest resistens konstaterats mot ciprofloxacin, sulfametoxazol, tetracyklin och trimetoprim. Ciprofloxacinresistens konstaterades 2022 mer än förr, cirka 8 procent. År 2022 konstaterades mest resistens mot tetracyklin (10 %). I Finland har produktionsfjäderfä inte medicinerats sedan 2009, vilket antagligen återspeglas i den goda resistenssituationen.
Bilden visar huvudsakligen de antibiotika som det förekommit mest resistens mot. Resistenstalen för alla antibiotika visas i nedanstående tabell över fördelning av MIC-värden.
Fördelning av MIC: Resistens mot antibiotika hos E. coli -bakterier som isolerats från broilrar år 2022 (pdf)
Svin
Hos E. coli -indikatorbakterier som har isolerats från svin har mest resistens konstaterats mot ampicillin, streptomycin, sulfametoxazol, tetracyklin och trimetoprim. Den resistens som har observerats återspeglar delvis de antibiotika som man vet att används för svin. Tetracyklinresistens har konstaterats mest, men från 2013 till 2019 har andelen resistenta stammar minskat varje år och 2021 låg den på 2019 års nivå på ca 14 %. År 2023 steg dock andelen stammar som var resistenta mot tetracyklin till 16,5 %. Andelen stammar som var resistenta mot ampicillin ökade också och de var 12,9 % 2023 (8,2 % 2021). Resistensen mot sulfametoxazol och trimetoprim har minskat sedan 2015. År 2023 var andelen sulfametoxazolresistenta stammar 11,8 % och trimetoprimresistenta 10 %. Uppföljningen av streptomycinresistens hos E. coli-indikatorbakterier upphörde 2014 i hela Europa. Endast lite ciprofloxacinresistens har konstaterats under hela uppföljningsperioden sedan 2004 (0–2 %). År 2023 var andelen resistenta stammar 0,6 %.
Bilden visar huvudsakligen de antibiotika som det förekommit mest resistens mot. Resistenstalen för alla antibiotika visas i nedanstående tabell över fördelning av MIC-värden.
Fördelning av MIC: Resistens mot antibiotika hos E. coli -bakterier som isolerats från svin år 2023 (pdf)
Nötkreatur
Hos de E. coli -indikatorbakterier som har isolerats från nöt har endast lite resistens konstaterats. Mest resistens mot streptomycin har konstaterats (cirka 5 procent år 2012), men uppföljningen av denna upphörde 2014. I Finland har resistensen mot samtliga andra antibiotika som har undersökts varit ännu mindre.
Bilden visar huvudsakligen de antibiotika som det förekommit mest resistens mot. Resistenstalen för alla antibiotika visas i nedanstående tabell över fördelning av MIC-värden.
Fördelning av MIC: Resistens mot antibiotika hos E. coli -bakterier som isolerats från nötkreatur år 2020 (pdf)
Betydelsen av resistensen hos indikatorbakterier i Finland
I Finland har förekomsten av resistens hos E. coli -indikatorbakterier hållits på en ganska måttlig nivå ända sedan uppföljningen av resistens inleddes. I Finland konstateras betydligt mindre resistens än i EU-länderna i medeltal. Mest resistens har konstaterats hos indikatorbakterier isolerade från svin och minst från indikatorbakterier isolerade från nöt.