Tiivistelmä:
Vesihomeet ovat makeissa vesissä laajasti esiintyviä sienen kaltaisia mikrobeja eli oomykeettejä. Erityisesti Saprolegnia-suvun lajit aiheuttavat lohikalojen viljelyssä suuria ongelmia maailman laajuisesti. Lisäksi luonnon lohikaloista on kuvattu joukkokuolemia, joissa syynä arvellaan olevan vesihome. Tällä hetkellä ei ole käytettävissä tarpeeksi tehokasta hoitokeinoa tai nopeita diagnostiikka- eli tunnistamismenetelmiä vesihomeelle, minkä vuoksi vesihomeen torjunta ja hoito on ongelmallista. Myös vesihomeen taudinaiheutusmekanismeja tunnetaan huonosti.
Hankkeessa tutkitaan pääasiassa Suomesta kerättyjen vesihomekantojen genotyyppejä. Altistus- ja kenttäkokeilla tutkitaan kaloilta eristettyjen bakteerien vaikutusta vesihomeen taudinaiheutuskykyyn. Näiden tietojen perusteella kehitetään Suomessa tärkeiden vesihomeen genotyyppien ja niiden taudinaiheutuskykyyn vaikuttavien bakteerien PCR-analytiikkaa. Lopuksi validoidaan diagnostiseen käyttöön uusi kvantitatiivinen multiplex PCR-analyysi, jolla voidaan tutkia sekä kaloista että ympäristöstä, vesihomeen ja bakteerien määriä kalanviljelylaitoksilla.
Tavoitteet:
- Tutkia vesihomeen eri genotyyppien esiintymistä Suomessa ja niiden eroja taudinaiheutuskyvyssä.
- Selvittää vesihometaudin bakteeriperäisiä riskitekijöitä.
- Kehittää vesihomeen ja siihen liittyvien bakteerien nopeampaa ja tarkempaa tunnistusmenetelmää (multiplex PCR).
Näiden tulosten avulla voidaan edelleen kehittää:
- kalanviljelylaitoksen ympäristöstä tulevan tautipaineen arviointia
- taudin torjunta- ja hoitomenetelmiä kalanviljelylaitoksilla
Asiasanat:
Vesihome, Saprolegnia sp. genotyypitys, Iodobacter sp., Flavobacterium sp., PCR
Hankkeen vastuullinen johtaja:
Viljamaa-Dirks Satu, johtava asiantuntija, Ruokavirasto, eläintautibakteriologian ja -patologian yksikkö
Ruokaviraston hankevastaava:
Korkea-aho Tiina, tutkija, eläintautibakteriologian ja -patologian yksikkö
Yhteistyötahot:
Åbo Akademi;
Jyväskylän yliopisto
Hankkeen vaihe:
Päättynyt
Aloitusvuosi:
2018
Lopetusvuosi
2021
Hankkeen rahoitukseen osallistuu:
Euroopan unioni;
Euroopan meri- ja kalatalousrahasto (EMKR);
ELY-keskus
Hankkeen julkaisut ja loppuraportti:
Korkea-aho, T. L., Viljamaa-Dirks, S., Heinikainen, S., Kuronen, H., & Tiirola, M. (2021). Genetic diversity and phenotypic characterization of Iodobacter limnosediminis associated with skin lesions in freshwater fish. Journal of Fish Diseases, 44, 1711– 1724. https://doi.org/10.1111/jfd.13490
Tiina Korkea-aho (Ruokavirasto), Satu Viljamaa-Dirks (Ruokavirasto), Tom Wiklund (Åbo Akademi), Lotta-Riina Sundberg (Jyväskylän yliopisto) (2022). Bakteerien merkitys vesihomeen esiintymisessä ja
vesihomeen sekä bakteerien PCR-tunnistusmenetelmät - loppuraportti, Ruokaviraston raportti (pdf).
Engblom, C., Landor, L., Sjöqvist, C., Korkea-aho, T., Viljamaa-Dirks, S., Paulin, L., & Wiklund, T. (2023). Identification and genetic characterization of Saprolegnia parasitica, isolated from farmed and wild fish in Finland. Journal of Fish Diseases, 46, 849–860. https://doi.org/10.1111/jfd.13795
Lisätietoa:
Suomen kalankasvattajaliitto ry -uutiskirje
